医院学科综合实力强大，临床医学ESI排名处于行列（全球前1‰）。在教育部2017年一级学科评估中，临床医学和护理学排名A-，中西医结合医学均排名B+；现有教育部国家重点学科9个，重点培育学科2个；有国家临床重点专科34个，数量名列全国医院。在国家三级公立医院绩效考核连续两年排名全国第二，等级A++。在复旦大学中国佳专科声誉和佳医院排行榜上，连续12年名列全国第二，其中12个专科前三、20个前五、30个前十。领军人才方面，有两院院士1人、CJ学者13人、国家教学名师4人、国家杰青14人、高级职称1404人、研究生导师940人。